Systém R je poměrně univerzálním softwarovým nástrojem a prostředím pro zpracování dat a jejich analýzu, výpočty a tvorbu grafických výstupů. Základem je interpretovaný programovací jazyk s podporou větvení, iterací a modulárního programování pomocí funkcí, jehož návrh vychází z návrhů jazyka S Chamberse a Wilkse a jazyka Scheme a který dává uživateli možnost efektivně definovat funkce pro řešení specifických potřeb. Pro účely zvýšení efektivity výpočtů je navíc možné z prostředí R přistupovat k procedurám vytvořeným v jazycích C, C++ nebo Fortran. Systém R dále obsahuje běhové prostředí a nástroj pro ladění programů a umožňuje spouštět skripty uložené v souborech.
RStudio je grafická nadstavba a IDE pro R, přístupná pomocí běžného webového prohlížeče. Podporuje správu projektů, import dat z mnoha formátů, interaktivní práci s daty atd. Distribuováno je pod veřejnou licencí, lze jej tedy libovolně zdarma používat. Pro účely práce ve skupinách je výhodná podpora autentizace uživatelů s přístupem k osobním kontům. Dovolí-li to nastavení serveru, je možné se připojit z kteréhokoli počítače schopného prohlížení webových stánek odkudkoli na světě.
Autentizace uživatelů je oddělená od zbytku EFISu a je tedy třeba se přihlásit znova. Uživatelé příslušní do TUL použijí přihlašovací udaje LIANE, ostatní potom uživatelské jméno a heslo, které jim bylo pro daný účel přiděleno.